دانشکده دارای 5 بخش آموزشی یا دپارتمان علمی است که هرکدام متناسب به رشته تخصصی خود به آموزش دانشجویان دوره عمومی و تخصصی، راهبری پروژه های عملی - پژوهشی دانشکده و سرپرستی آزمایشگاههای مربوطه می پردازند.
ردیف | گروهای آموزشی دانشکده |
1 | فارماکولوژی و توکسیکولوژی |
2 | فارماسیوتیکس و کنترل دارو |
3 | شیمی دارویی و داروسازی هسته ای |
4 | بیوتکنولوژی دارویی و فارماکوگنوزی |
5 | داروسازی بالینی و اقتصاد و مدیریت دارو |